Co warto wiedzieć
- Plik FNA to plik FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment.
- Otwórz jeden z Geneious.
- Konwertuj na FASTA i podobne formaty za pomocą tego samego programu.
Ten artykuł wyjaśnia, czym jest plik FNA, jak go otworzyć i jak go zapisać w innym formacie, takim jak FASTA, GB, VCF, obrazy itp.
Co to jest plik FNA?
Plik z rozszerzeniem FNA to plik FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment, który przechowuje informacje DNA, które mogą być używane przez oprogramowanie do biologii molekularnej.
W szczególności pliki FNA mogą być używane do przechowywania tylko informacji o kwasach nukleinowych, podczas gdy inne formaty FASTA zawierają inne informacje związane z DNA, takie jak te z FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ rozszerzenia plików, NET lub AA.
Te tekstowe formaty FASTA powstały pierwotnie z pakietu oprogramowania o tej samej nazwie, ale są obecnie używane jako standard w aplikacjach do dopasowywania sekwencji DNA i białek.
FNA odnosi się również do pewnych terminów technologicznych, które nie mają nic wspólnego z tym formatem pliku, takich jak ostateczna akceptacja sieciowa, funkcja rozszerzania nazwy pliku/atrybutu, architektura sieci Fujitsu i reklama szybkiego sąsiada.
Jak otworzyć plik FNA
Otwórz jeden w systemach Windows, macOS i Linux z Geneious (bezpłatnie przez 14 dni). Aby to zrobić, przejdź do menu File > Import i wybierz import pliku za pomocą From Filepozycja menu.
Możesz również otworzyć jeden za pomocą generatora obrazu BLAST Ring (BRIG).
Wypróbuj Notepad++ lub inny edytor tekstu, jeśli te pomysły nie działają. Plik może rzeczywiście być tekstowy i łatwy do odczytania lub może się okazać, że nie ma nic wspólnego z formatem FASTA, w którym to przypadku otwarcie pliku jako dokumentu tekstowego może ujawnić tekst, który identyfikuje, co zostało użyte do utworzenia pliku lub w jakim formacie jest plik.
Jak przekonwertować plik FNA
Nie możemy tego zweryfikować, ponieważ nie próbowaliśmy tego, ale powinieneś być w stanie użyć Geneious do konwersji pliku do wielu innych formatów, takich jak FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV i VCF. Można to zrobić za pomocą menu Plik > Eksportuj.
Ten sam program powinien być w stanie zapisać plik w formacie PNG, JPG, EPS lub PDF, za pośrednictwem File > Zapisz jako plik obrazu.
Chociaż zwykle nie możesz po prostu zmienić nazwy rozszerzenia pliku na coś innego i oczekiwać, że będzie działać w ten sam sposób, możesz zmienić nazwę pliku. FNA na plik. FA, jeśli dane oprogramowanie do sekwencjonowania DNA rozpozna tylko format FA.
Zamiast zmieniać nazwy rozszerzeń plików, będziesz chciał użyć darmowego konwertera plików do konwersji innych typów plików. W przypadku plików FNA i FA zdarza się, że niektóre programy będą otwierać tylko pliki, które mają rozszerzenie pliku FA, w takim przypadku zmiana nazwy powinna zadziałać.
Nadal nie możesz go otworzyć?
Jeśli po użyciu powyższych programów nadal nie możesz otworzyć pliku, może się okazać, że rozszerzenie pliku w rzeczywistości nie odczytuje. FNA, ale coś, co wygląda podobnie.
Na przykład pliki FNG (Font Navigator Group) wyglądają bardzo podobnie do nazwy ". FNA", ale jeśli przyjrzysz się uważnie, tylko dwie pierwsze litery są takie same. Ponieważ rozszerzenia plików są różne, oznacza to, że mają inny format pliku i najprawdopodobniej nie będą działać z tymi samymi programami.
To samo można powiedzieć o wielu innych rozszerzeniach plików, takich jak FAX, FAS (skompilowane szybkie ładowanie AutoLISP), FAT, FNTA (czcionka Aleph One), FNC (funkcje Vue) i FND (zapisane wyszukiwanie w systemie Windows).
Pomysł polega na tym, aby upewnić się, że rozszerzenie pliku brzmi. FNA. Jeśli tak, spróbuj ponownie użyć powyższych programów, aby go otworzyć lub przekonwertować. Jeśli masz inny rodzaj pliku, sprawdź jego rozszerzenie, aby dowiedzieć się, jakie aplikacje są potrzebne do jego otwarcia lub konwersji.
FAQ
Jak otworzyć plik FNA w Pythonie?
Najpierw przekonwertuj plik FNA do formatu FASTA za pomocą aplikacji innej firmy, takiej jak Geneious. Następnie możesz pobrać Biopython, zestaw ogólnodostępnych narzędzi do obliczeń biologicznych do pracy w bioinformatyce. Na koniec zapoznaj się z samouczkiem Biopython i książką kucharską, aby uzyskać instrukcje dotyczące pracy z plikami FASTA.
Jak znaleźć numery producenta FNA w nieprzetworzonym pliku Ancestry?
Większość danych DNA można pobrać ze strony Ancestry.com w formacie.txt. Jednak tylko klienci, których DNA zostało przeanalizowane za pomocą sekwencjonowania nowej generacji (NGS), mają możliwość pobrania pliku VCF. Aby pobrać plik VCF, musisz być właścicielem DNA, poddać się testom DNA przy użyciu technologii NGS i mieć co najmniej 350 MB wolnego miejsca na swoim urządzeniu.
